酒造りを支える麹菌のしくみを探る リボスイッチの応用とピリチアミン耐性遺伝子の解明

白鶴酒造では、日本酒づくりを支える中核的な存在である麹菌(Aspergillus oryzae)を、単なる発酵微生物としてではなく、高度な生命機能を備えた研究対象として捉え、長年にわたり研究を重ねてきました。麹菌は、酵素の産生や香味形成などを通して酒質に大きな影響を与える重要な微生物です。白鶴酒造では、伝統的な酒造技術を基盤としながら、麹菌の遺伝子機能や代謝のしくみを科学的に解き明かし、新たな技術基盤の構築を目指しています。

1.リボスイッチの発見と応用研究

白鶴酒造の研究により、麹菌において真核生物として初めて、リボスイッチが遺伝子発現を制御する仕組みが明らかになりました。リボスイッチとは、mRNA自身がビタミンなどの低分子化合物を感知し、遺伝子のON/OFFを切り替える制御機構です。これまで主に細菌で知られていたこの仕組みが、麹菌にも存在することが示されました。

本研究では、ビタミンB₁(チアミン)の活性型であるチアミンピロリン酸(TPP)がmRNAに直接結合することで、スプライシングの様式が変化し、遺伝子発現が調節されることを明らかにしました。さらに、TPPの量に応じてスプライシングされる位置が切り替わり、タンパク質が合成される場合とされない場合が精密に制御されていることが分かりました。

白鶴酒造では、この天然の仕組みを応用し、TPPの添加によって遺伝子発現がONになる人工リボスイッチの開発にも成功しています。スプライシング部位や翻訳開始コドンを設計することで、チアミン添加時に発現量が約14倍に増加し、実用レベルで遺伝子発現を制御できるTPP結合型ONリボスイッチを確立しました。

この技術は、麹菌が生産する酵素や有用成分を「必要なときに、必要な量だけ」効率良く生産することを可能にし、発酵プロセスの高度化につながる技術として期待されています。

  • リボスイッチによる遺伝子発現制御の仕組み
  • TPP結合型ONリボスイッチの応用

2. ピリチアミン耐性遺伝子の単離と解析

白鶴酒造では、麹菌の育種技術の一環として、チアミン拮抗物質であるピリチアミン(PT)に耐性を示す遺伝子 ptrA を世界で初めて単離し、その性質を明らかにしました。PTは、通常の麹菌ではごく低濃度でも生育を強く阻害する化合物ですが、白鶴酒造ではPT耐性を示す麹菌株を取得し、ゲノムライブラリー解析によって耐性の原因遺伝子を特定しました。

単離された ptrA は、チアミン生合成に関与する既知遺伝子 thi4 と高い相同性を持ち、調節領域に生じた変異がPT耐性を引き起こしていることが分かりました。この遺伝子を麹菌に導入すると、通常は生育できないPT含有培地においても生育が可能となり、ptrAが強力な薬剤耐性マーカーとして機能することが確認されています。

さらに、この耐性は優性形質であるため、野生型麹菌をそのまま育種の出発材料とすることが可能になります。従来必要であった栄養要求株の作製が不要となり、形質転換効率の向上や、目的遺伝子の安定的な導入を可能にする技術基盤の構築につながります。

  • ピリチアミン耐性遺伝子ptrAの単離と解析
  • ptrAによる薬剤耐性マーカーの機能確認

酒造りと基礎科学をつなぐ白鶴酒造の研究

これらの研究成果は、日本酒の品質向上に寄与するだけでなく、「国菌」とも呼ばれる麹菌の生命現象を解き明かす基礎科学としても大きな意義を持っています。白鶴酒造は、伝統を大切にしながら科学的知見を積み重ね、酒造りの未来を支える研究開発にこれからも取り組んでいきます。

受賞

  • 清酒麹菌の分子育種に関する研究:日本生物工学会第38回江田賞(2005)

    山下信雄、窪寺隆文

  • 麹菌Aspergillus oryzaeにおけるTPP合成機構の解析:日本醸友会奨励賞受賞 (2011)

    徳井美里

  • 麴菌の薬剤耐性マーカー(ptrA)の開発とリボスイッチの発見:糸状菌遺伝子研究会技術賞(2011)

    窪寺隆文、山下信雄、山内隆寛

論文

  • Pyrithiamine resistance gene (ptrA) of Aspergillus oryzae cloning, characterization and application as a dominant selectable marker for transformation, Biosci. Biotechnol. Biochem. 64, 1416–1421 (2000)

    窪寺隆文、山下伸雄、西村顕

  • Transformation of Aspergillus sp. and Trichoderma reesei using the pyrithiamine resistance gene (ptrA) of Aspergillus oryzae, Biosci. Biotechnol. Biochem. 66, 404–406 (2002)

    窪寺隆文、山下伸雄、西村顕

  • Thiamine-regulated gene expression of Aspergillus oryzae thiA requires splicing of the intron containing a riboswitch-like domain in the 5P-UTR, FEBS Lett. 555, 516–520 (2003)

    窪寺隆文、渡辺睦、吉内くみ、山下伸雄、西村顕、中井進、五味勝也¹、花本秀生(¹東北大・院農・未来バイオ)

  • 麹菌の新規な発現制御機構 :タンパク質を介さない発現制御機構の発見 生物工学会誌、82、548(2004)

    窪寺隆文

  • Roles of Mg2+ in TPP-dependent riboswitch, FEBS Lett. 579, 2583–2588 (2005)

    山内 貴裕、三好 大輔¹、窪寺 隆文、西村 顕、中井 進¹、杉本 直己¹²(¹甲南大学 先端生命工学研究所、²甲南大学 理工学部・物質化学科)

  • 清酒麹菌の分子育種に関する研究 生物工学会誌、84、89-95(2006)

    山下信雄、窪寺隆文

  • Riboswitches for enhancing target gene expression in eukaryotes, ChemBioChem 9, 1040–1043 (2008)

    山内 貴裕、三好 大輔¹、窪寺 隆文、伴 光博、西村 顕、杉本 直己¹²(¹甲南大学 先端生命工学研究所、²甲南大学 理工学部・物質化学科)

  • Construction of a thiamine pyrophosphate high-producing strain of Aspergillus oryzae by overexpression of three genes involved in thiamine biosynthesis, J. Biosci. Bioeng. 111, 388–390 (2011)

    徳井 美里、窪寺 隆文、五味 勝也¹、山下 伸雄、西村 顕(¹東北大院農 生物産業情報・ゲノミクス分野)

  • Rational Design of a New IMP Aptamer Based on a TPP Riboswitch and a Hypoxanthine Aptamer, Chem. Lett. 40, 1313–1314 (2011)

    徳井 美里、山内 貴裕、三好 大輔¹、神谷 久也、西村 顕、杉本 直己¹²(¹甲南大学 先端生命工学研究所、²甲南大学 理工学部・物質化学科)

  • Artificial turn-on riboswitch to control target gene expression using a wild-type riboswitch splicing mechanism, J. Biosci. Bioeng. 131, 115–123 (2021)

    山内 貴裕、窪寺 隆文、三好 大輔¹、杉本 直己¹²、広畑 修二(¹甲南大学 先端生命工学研究所、²甲南大学 理工学部・物質化学科)

  • 麴菌のTPP結合型リボスイッチによる遺伝子発現制御機構とその応用 バイオサイエンスとインダストリー、82、466-469(2024)

    山内隆寛

学会発表

  • 麹菌A.oryzaeのピリチアミン耐性 生物工学会(1997)

    窪寺隆文

  • 麹菌A.oryzaeのピリチアミン耐性遺伝子のクローニング(第2報)生物工学会(1998)

    窪寺隆文

  • 麹菌A.oryzaeのピリチアミン耐性遺伝子に関する研究(第3報)日本農芸化学会(1999)

    窪寺隆文、山下伸雄、元吉徹、西村顕

  • 麹菌 A. oryzae のピリチアミン耐性遺伝子に関する研究(第4報)日本農芸化学会(2000)

    窪寺隆文、山下伸雄、元吉徹、西村顕

  • 麹菌 A. oryzae のピリチアミン耐性遺伝子に関する研究(第5報)日本農芸化学会(2001)

    窪寺隆文、山下伸雄、西村顕

  • Aspergillus oryzae チアミン生合成遺伝子thiAの転写制御に関与するcis因子の役割 日本農芸化学会(2003)

    窪寺隆文、大西智子、吉内くみ、山下信雄、山中博司、西村顕

  • Aspergillus oryzae thiA のチアミンによる選択的スプライシング機構 日本農芸化学会(2004)

    窪寺隆文、渡辺睦、山下伸雄、西村顕、五味勝也¹、中井 進(¹東北大学大学院農学研究科・生物産業創成科学専攻)

  • チアミンピロリン酸結合型リボスイッチの機能解析 日本生物工学会(2005)

    山内隆寛¹²、三好大輔²、窪寺隆文¹、伴光博¹、西村顕¹、杉本直己²³(¹白鶴酒造・研究開発、²甲南大・先端生命工学研究所、³甲南大・理工)

  • 清酒麹菌の分子育種に関する研究 日本生物工学会(2006)

    山下伸雄、窪寺隆文

  • 麹菌Aspergillus oryzae のチアミン高生産株の分子育種 糸状菌分子生物コンファレンス(2006)

    徳井 美里、窪寺 隆文、五味 勝也¹、山下 伸雄、伴 光博、西村 顕(¹東北大学大学院農学研究科・生物産業創成科学専攻)

  • TPP結合型リボスイッチの機能改変 日本生物工学会(2006)

    山内隆寛¹²、三好大輔²、窪寺隆文¹、伴光博¹、西村顕¹、杉本直己²³(¹白鶴酒造・研究開発、²甲南大・先端生命工学研究所、³甲南大・理工)

  • 変異導入によるチアミンピロリン酸(TPP)結合型リボスイッチのTPP結合阻害 日本化学会 (2006)

    山内隆寛¹²、三好大輔²、窪寺隆文¹、伴光博¹、西村顕¹、杉本直己²³(¹白鶴酒造・研究開発、²甲南大・先端生命工学研究所、³甲南大・理工)

  • TPPリボスイッチを用いた新規アプタマーの合理的設計 日本生物工学会 (2011)

    徳井 美里¹², 山内 隆寛¹², 三好 大輔²³, 西村 顕¹, 杉本 直己²³(¹白鶴酒造・研究開発、²甲南大学先端生命工学研究所(FIBER)、³甲南大学 フロンティアサイエンス学部(FIRST))